为确保医师资格考试公平公正、安全有效，国家医学考试中心根据实际工作需要，不断建立健全医师资格考试工作各项规章制度。2008年，在认真梳理以往各项工作的基础上，制修订了《国家医学考试中心保密规定（暂行）》、《2008年医师资格考试试题开发工作规程》、《2008年医师资格考试考务管理工作规程》和《2008年医师资格考试阅卷及合格线推荐工作规程》。2009年，在总结一年来实施上述规定、规程的基础上，又组织进行了完善和修订，形成新的《国家医学考试中心保密规定（暂行）》和《医师资格考试试题开发工作规程（暂行）》、《医师资格考试考务管理工作规程（暂行）》、《医师资格考试医学综合笔试阅卷及合格分数线确定工作规程（暂行）》，全方位规范医师资格考试各项工作运转，尤其是加强了安全保密工作环节监管。

　　为确保“一规定三规程”有效落实，国家医学考试中心还制定了《国家医学考试中心处室考核办法（暂行）》、《国家医学考试中心责任事故追究管理办法（暂行）》等相关内部管理办法，加强管理，严格监督，促进医师资格考试各项工作安全规范有序开展。